MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 1283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017073	AGT	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755758
2	NC_017073	AAG	2	6	25	30	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755758
3	NC_017073	GGC	2	6	31	36	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755758
4	NC_017073	AAC	2	6	45	50	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755758
5	NC_017073	GTCC	2	8	93	100	0 %	25 %	25 %	50 %	383755758
6	NC_017073	TTGATC	2	12	107	118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383755758
7	NC_017073	TTA	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755758
8	NC_017073	AAG	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755758
9	NC_017073	CT	3	6	319	324	0 %	50 %	0 %	50 %	383755758
10	NC_017073	ACT	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755758
11	NC_017073	CAT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755758
12	NC_017073	TACTG	2	10	552	561	20 %	40 %	20 %	20 %	383755758
13	NC_017073	AT	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	383755758
14	NC_017073	TAA	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755758
15	NC_017073	CAAT	2	8	766	773	50 %	25 %	0 %	25 %	383755759
16	NC_017073	AAG	2	6	844	849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
17	NC_017073	ACC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755759
18	NC_017073	GAA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
19	NC_017073	CGT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755759
20	NC_017073	ATATG	2	10	1013	1022	40 %	40 %	20 %	0 %	383755759
21	NC_017073	CGC	2	6	1041	1046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755759
22	NC_017073	AAG	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
23	NC_017073	GAA	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
24	NC_017073	CCT	2	6	1101	1106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755759
25	NC_017073	GAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
26	NC_017073	AATAA	2	10	1147	1156	80 %	20 %	0 %	0 %	383755759
27	NC_017073	ATGCA	2	10	1205	1214	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017073	TA	3	6	1221	1226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017073	ATT	2	6	1330	1335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017073	T	6	6	1334	1339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017073	A	6	6	1408	1413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017073	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755760
33	NC_017073	TCG	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755760
34	NC_017073	TCTA	2	8	1612	1619	25 %	50 %	0 %	25 %	383755760
35	NC_017073	TCA	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755760
36	NC_017073	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755760
37	NC_017073	CAT	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017073	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	383755761
39	NC_017073	GAT	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
40	NC_017073	TGC	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
41	NC_017073	ACA	2	6	2030	2035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755761
42	NC_017073	CTT	2	6	2064	2069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
43	NC_017073	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
44	NC_017073	TGCC	2	8	2106	2113	0 %	25 %	25 %	50 %	383755761
45	NC_017073	GGCCC	2	10	2139	2148	0 %	0 %	40 %	60 %	383755761
46	NC_017073	ATC	2	6	2151	2156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755761
47	NC_017073	TGG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755761
48	NC_017073	TTA	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755761
49	NC_017073	ATCGC	2	10	2413	2422	20 %	20 %	20 %	40 %	383755761
50	NC_017073	GGA	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755761
51	NC_017073	AGC	2	6	2467	2472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755761
52	NC_017073	TTC	2	6	2493	2498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
53	NC_017073	GTCC	2	8	2523	2530	0 %	25 %	25 %	50 %	383755761
54	NC_017073	ATAC	2	8	2633	2640	50 %	25 %	0 %	25 %	383755761
55	NC_017073	CCG	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755761
56	NC_017073	TTG	2	6	2934	2939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755761
57	NC_017073	TCA	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755761
58	NC_017073	GTA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
59	NC_017073	TCG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
60	NC_017073	ATA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755761
61	NC_017073	GT	3	6	3224	3229	0 %	50 %	50 %	0 %	383755761
62	NC_017073	GGC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755761
63	NC_017073	TGC	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
64	NC_017073	ACGTTC	2	12	3405	3416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383755761
65	NC_017073	TCG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
66	NC_017073	ACG	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755761
67	NC_017073	TTC	2	6	3558	3563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
68	NC_017073	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
69	NC_017073	CTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
70	NC_017073	GAA	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755761
71	NC_017073	CGT	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
72	NC_017073	CCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755761
73	NC_017073	GCA	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755761
74	NC_017073	ATT	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755761
75	NC_017073	GAT	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
76	NC_017073	T	6	6	3954	3959	0 %	100 %	0 %	0 %	383755761
77	NC_017073	TC	3	6	4034	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	383755761
78	NC_017073	CTT	2	6	4058	4063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
79	NC_017073	CCG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755761
80	NC_017073	ACC	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755761
81	NC_017073	GACA	2	8	4492	4499	50 %	0 %	25 %	25 %	383755761
82	NC_017073	C	7	7	4505	4511	0 %	0 %	0 %	100 %	383755761
83	NC_017073	TCG	2	6	4534	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
84	NC_017073	GAT	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
85	NC_017073	CA	3	6	4722	4727	50 %	0 %	0 %	50 %	383755761
86	NC_017073	CAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755761
87	NC_017073	TCA	2	6	4949	4954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755762
88	NC_017073	TTC	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017073	ACA	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017073	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017073	A	7	7	5196	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017073	GCA	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017073	CGATG	2	10	5347	5356	20 %	20 %	40 %	20 %	383755763
94	NC_017073	AAC	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755764
95	NC_017073	TCC	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755764
96	NC_017073	ATA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755764
97	NC_017073	GCT	2	6	5573	5578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755764
98	NC_017073	CT	3	6	5577	5582	0 %	50 %	0 %	50 %	383755764
99	NC_017073	ATC	2	6	5791	5796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755765
100	NC_017073	CAT	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755765
101	NC_017073	CAGGA	2	10	5882	5891	40 %	0 %	40 %	20 %	383755765
102	NC_017073	TTC	3	9	5975	5983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755766
103	NC_017073	AAT	2	6	6010	6015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755766
104	NC_017073	AT	3	6	6051	6056	50 %	50 %	0 %	0 %	383755766
105	NC_017073	CCAA	2	8	6110	6117	50 %	0 %	0 %	50 %	383755766
106	NC_017073	CAA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755766
107	NC_017073	GCA	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755766
108	NC_017073	GTC	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755766
109	NC_017073	CGG	2	6	6253	6258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755766
110	NC_017073	TCC	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755766
111	NC_017073	ATC	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755766
112	NC_017073	CTT	3	9	6392	6400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755766
113	NC_017073	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755766
114	NC_017073	CTTG	2	8	6562	6569	0 %	50 %	25 %	25 %	383755766
115	NC_017073	AATC	2	8	6586	6593	50 %	25 %	0 %	25 %	383755766
116	NC_017073	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755766
117	NC_017073	GCT	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755766
118	NC_017073	AAG	2	6	6765	6770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755766
119	NC_017073	GCATC	2	10	6850	6859	20 %	20 %	20 %	40 %	383755766
120	NC_017073	TTC	2	6	7122	7127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755767
121	NC_017073	CGA	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755767
122	NC_017073	CCTTTT	2	12	7163	7174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755767
123	NC_017073	A	6	6	7181	7186	100 %	0 %	0 %	0 %	383755767
124	NC_017073	ATT	2	6	7254	7259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755767
125	NC_017073	TGT	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755767
126	NC_017073	ACA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017073	TTATTT	2	12	7381	7392	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017073	A	7	7	7416	7422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017073	CCA	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017073	TAG	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017073	GCT	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755768
132	NC_017073	T	6	6	7542	7547	0 %	100 %	0 %	0 %	383755768
133	NC_017073	T	6	6	7718	7723	0 %	100 %	0 %	0 %	383755768
134	NC_017073	AACC	2	8	7924	7931	50 %	0 %	0 %	50 %	383755768
135	NC_017073	GCA	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755768
136	NC_017073	CTTA	2	8	8016	8023	25 %	50 %	0 %	25 %	383755768
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395	NC_017073	CTT	2	6	23657	23662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755780
396	NC_017073	GTA	2	6	23760	23765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755780
397	NC_017073	TAA	2	6	23766	23771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755780
398	NC_017073	GCA	2	6	23796	23801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755780
399	NC_017073	GCCT	2	8	23840	23847	0 %	25 %	25 %	50 %	383755780
400	NC_017073	GACG	2	8	23890	23897	25 %	0 %	50 %	25 %	383755780
401	NC_017073	GCTG	2	8	23942	23949	0 %	25 %	50 %	25 %	383755780
402	NC_017073	TCG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755780
403	NC_017073	CTG	2	6	23993	23998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755780
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405	NC_017073	TTC	2	6	24095	24100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755780
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414	NC_017073	TTA	3	9	24648	24656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755780
415	NC_017073	TGA	2	6	24672	24677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755780
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420	NC_017073	CCATT	2	10	24918	24927	20 %	40 %	0 %	40 %	383755780
421	NC_017073	CTG	2	6	24982	24987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755780
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424	NC_017073	TTC	2	6	25103	25108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755780
425	NC_017073	TAG	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755780
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427	NC_017073	TCA	2	6	25266	25271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755780
428	NC_017073	TTC	2	6	25313	25318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755780
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430	NC_017073	GCA	2	6	25494	25499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755780
431	NC_017073	GCA	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755780
432	NC_017073	AGG	2	6	25545	25550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755780
433	NC_017073	AGC	2	6	25565	25570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755780
434	NC_017073	ATG	2	6	25581	25586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755780
435	NC_017073	ACC	2	6	25595	25600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755780
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476	NC_017073	CGCTG	2	10	27831	27840	0 %	20 %	40 %	40 %	383755780
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487	NC_017073	TA	3	6	28955	28960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017073	CCT	2	6	28996	29001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
489	NC_017073	TGT	2	6	29069	29074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
490	NC_017073	A	6	6	29159	29164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017073	G	6	6	29168	29173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
492	NC_017073	T	6	6	29259	29264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_017073	T	7	7	29355	29361	0 %	100 %	0 %	0 %	383755781
494	NC_017073	ATG	2	6	29382	29387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755781
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496	NC_017073	T	6	6	29494	29499	0 %	100 %	0 %	0 %	383755782
497	NC_017073	GAA	2	6	29550	29555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755782
498	NC_017073	TCC	2	6	29646	29651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_017073	TTC	2	6	29705	29710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_017073	CTT	2	6	29714	29719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755783

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